Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ANKRD39Q53RE8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms