Protein–RNA interactions for Protein: Q50LG9

LRRC24, Leucine-rich repeat-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC24Q50LG9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC24Q50LG9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC24Q50LG9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms