Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC1Q4VXA5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms