Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CFAP100Q494V2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP100Q494V2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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