Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM176BQ3YBM2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM176BQ3YBM2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms