Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms