Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms