Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT24Q2M2I5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms