Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF4Q2M2E3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms