Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC27Q2M243 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms