Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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