Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RTL8BQ17RB0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTL8BQ17RB0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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