Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDO1Q16878 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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