Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FXNQ16595 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms