Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LY6EQ16553 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LY6EQ16553 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms