Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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LAMA4Q16363 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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LAMA4Q16363 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA4Q16363 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms