Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTH1Q15438 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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