Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUM3Q15397 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PUM3Q15397 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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PUM3Q15397 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PUM3Q15397 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PUM3Q15397 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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