Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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