Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB39AQ14964 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RAB39AQ14964 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB39AQ14964 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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