Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSPNQ14714 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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