Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H2Q13888 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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