Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BFSP2Q13515 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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