Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3FQ13275 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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