Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME3Q13232 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME3Q13232 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NME3Q13232 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NME3Q13232 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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