Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPS1Q13098 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPS1Q13098 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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