Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MRPL28Q13084 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MRPL28Q13084 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms