Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC16Q13042 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms