Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
STRN3Q13033 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms