Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTP4A2Q12974 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTP4A2Q12974 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTP4A2Q12974 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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