Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CNTN1Q12860 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CNTN1Q12860 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CNTN1Q12860 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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