Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROQ12816 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROQ12816 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROQ12816 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROQ12816 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROQ12816 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROQ12816 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
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