Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms