Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms