Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDR1Q08345 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms