Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TFF3Q07654 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms