Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms