Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSPL2Q05D32 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms