Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACVR1Q04771 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1Q04771 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms