Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms