Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms