Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFITM3Q01628 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms