Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBBP68871 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HBBP68871 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HBBP68871 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms