Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIK1P57059 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIK1P57059 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIK1P57059 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIK1P57059 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIK1P57059 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms