Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN15P56746 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms