Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms