Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB5CP51148 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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