Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A3P48751 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms