Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK1DP48730 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK1DP48730 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms