Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms